最新研究成果
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29 Jan
清华大学生命科学学院隋森芳教授课题组发文报道酵母TRAPPII复合体特异激活GTP酶Ypt3…
囊泡转运是细胞内物质运输的主要方式,分为出芽、移动、拴系和融合四个步骤。由拴系蛋白介导的拴系是指转运小泡与其受体之间的初始、远距离相互作用,这一步被认为对于建立囊泡靶向转运的特异性是必不可少的。拴系蛋白TRAPP家族蛋白具有鸟嘌呤核苷酸交换功能,可以将Ypt/Rab GTP酶从非激活状态转换成激活状态,进而招募下游的效应因子调控囊泡运输。酵母TRAPPII是酵母TRAPP家族中最大的成员,分子量约为1MDa,调控高尔基...
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27 Jan
生命学院张强锋组和医学院胡小玉组联合开发低起始量全转录组RNA二级结构测量新技术
RNA分子能够折叠成复杂多变的结构,对转录后调控和非编码RNA执行特定功能至关重要。活细胞内部RNA结构检测技术是解析RNA结构如何参与调控各项生理过程的基础。然而现有的RNA结构检测技术不仅操作繁杂,还对RNA起始量有着很高的要求,这一局限性使得我们很难利用现有的技术对数量稀少的样品进行RNA二级结构检测。2022年1月24日,清华大学生命学院张强锋组和清华大学医学院/免疫学研究所胡小玉组联合在《自然科学基础研...
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20 Jan
生命学院王新泉与医学院张林琦、微软亚洲研究院王童合作揭示刺突蛋白N370位点糖基化…
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引发的疫情延续至今,目前我们对其跨物种传播途径与进化分子机制仍知之甚少。冠状病毒表面的刺突糖蛋白(spike)在病毒入侵宿主细胞过程中负责受体识别和介导膜融合,并且刺突蛋白的氨基酸序列与结构的分子进化影响其对不同物种受体的识别,因而刺突蛋白的分子进化是冠状病毒实现跨物种传播的一个关键因素。 蝙蝠冠状病毒RaTG13分离自中国云南省中华菊头蝠,与新冠病毒基因组序列一致...
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15 Jan
生命学院孟安明课题组发现小鼠胚胎第二极体建立细胞命运不对称性
人类和哺乳动物周期性地排卵,排出的卵子体积很大,它继承了卵母细胞的绝大部分细胞质和一个保留了2套染色体的细胞核;同时,还排出一个与卵子相连的体积很小的第一极体(PB1),第一极体仅含极少量的细胞质,但也有一个含2套染色体的细胞核,第一极体很快就凋亡。当一个精子的细胞核(雄原核,含有1套染色体)进入卵子后,卵子排出一个极小的、含1套染色体的细胞(第二极体PB2),因而卵子的核(雌原核)只剩下1套染色体(与第...
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11 Jan
生命学院江鹏课题组报道瓜氨酸代谢调控巨噬细胞炎症反应
巨噬细胞是机体抗感染免疫系统的重要组成部分,巨噬细胞的免疫功能受到细胞内外代谢物改变的影响。一直以来,精氨酸代谢被认为是调节巨噬细胞极化和炎症反应的重要代谢调节因素。在机体中,精氨酸属于尿素循环代谢途径的中间代谢物之一。清华大学生命学院江鹏课题组近期的一项研究,揭示了尿素循环的异常改变显著影响了肿瘤细胞的氨代谢和多胺的生物合成能力(Li et al. 2019, Nature),与肿瘤细胞不同。
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27 Dec
颉伟课题组发文揭示DNA甲基化通过去记忆化构建早期胚胎发育的表观屏障
早期胚胎发育起始于高度特化的精子和卵子的结合,从而形成全能性的受精卵。在这个过程中,表观遗传信息重编程对于擦除亲本表观遗传记忆和重建细胞全能性十分重要。研究结果表明,哺乳动物早期胚胎发育过程中DNA甲基化会在全基因组范围内发生显著的“擦除-重建”过程。与此截然不同的是,斑马鱼和非洲爪蟾蜍等非哺乳动物早期胚胎发育过程中全基因组DNA甲基化一直维持在相对较高的水平。目前人们对于不同物种在早期胚胎发育过程中...
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27 Nov
生命学院颉伟与北京农学院郭勇、中科院动物所李伟课题组合作发文揭示哺乳动物早期胚…
在生命起始的时候,高度特化的精子和卵子结合形成全能性的受精卵。在这一过程中,表观遗传信息发生了广泛而剧烈的重编程。同时,一些表观遗传信息如基因印记会被选择性的保留下来。由于哺乳动物配子和早期胚胎材料的稀缺,关于表观遗传信息在配子向胚胎转变(parental-to-embryonic transition)过程中是如何遗传和重编程的研究长期进展缓慢。近年来,由于一些高灵敏微量细胞染色质分析技术的出现,研究人员得以在分子水平研究...
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19 Nov
生命学院张强锋实验室开发RNA结构测序数据缺失信号恢复的人工智能方法
RNA结构是RNA发挥功能的基础。传统解析RNA结构的方法包括X射线、核磁共振和冷冻电子显微镜。这些方法无法做到高通量,更不能解析出细胞内高度动态的RNA结构。近年来,研究者们开发出了许多细胞内高通量探测RNA结构的技术,极大推动了RNA结构和功能的研究。但是这些技术探测到的RNA结构信号经常包含大量的缺失值,影响了后续对RNA功能的深入研究。人工智能方法在科学、技术多个领域都取得了成功应用,如果将其用于恢复由于实验和...
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10 Nov
生命学院张伟课题组发现咽喉部感受调节进食的神经机制
咀嚼和吞咽是进食的重要步骤。食物的味道、硬度或粘度会激发口腔内和咽喉处不同的感觉。有证据表明,食物对口腔和食道的刺激能够影响饱腹感的形成。然而,我们还不清楚咽喉部的神经元是如何感受食物刺激并且将信号传递给中枢大脑的。清华大学生命学院、清华IDG/麦戈文脑科学研究院张伟研究员课题组研究了咽喉中机械力感受调节果蝇进食的机制。果蝇的咽喉有丰富的感觉神经元。其中,共表达机械力受体NOMPC和味觉受体Gr43a的神经...
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08 Nov
生命学院方显杨与陈春来课题组合作报道黄病毒xrRNA构象动态与功能调控的分子机制
RNA具有多种重要的生理功能,可在遗传编码、基因表达、基因调控和酶催化等过程发挥作用。RNA功能的发挥与其可折叠形成复杂的三维空间结构以及构象的动态变化密切相关,在结合配体(例如蛋白质、DNA/RNA、小分子等)或响应环境 (例如离子浓度、温度、pH或机械力)变化时,RNA往往发生构象状态的转变。研究表明,RNA的三维空间结构通常是在二级结构的基础上,由共轴堆积、假结结构(pseudoknot)、A-小沟模体(A-minor motif)以及“吻式...