最新研究成果-清华大学生命科学学院

清华大学生命学院江鹏实验室揭示B细胞生发中心的形成及功能的代谢基础

B细胞是适应性免疫应答系统的重要组成部分，具有包括分泌病原体特异性抗体等多种免疫效应功能。生发中心（GCs）中的体细胞超突变和B细胞选择可提高抗体对免疫抗原的亲和力和特异性。因此，生发中心（GC）B 细胞对产生 GCs 和长效体液免疫至关重要。虽然关于生发中心（GCs）的调控研究不在少数，且代谢可能影响了B细胞亚群的多样性，但生发中心B细胞（GC B）的形成与功能是否依赖或决定于一种共有的代谢方式，是一个极其令人感兴...

25 Jul

闫创业与袁亚飞团队揭示去甲肾上腺素转运蛋白再摄取与抑制的分子基础

去甲肾上腺素 (Norepinephrine 或 noradrenaline；NE) 、多巴胺 (Dopamine；DA)和血清素 (Serotonin ；或5-羟色胺5-hydroxytryptamine, 5-HT) 是重要的单胺类神经递质，影响着包括运动、激素分泌、奖惩和情绪相关的复杂行为和生理过程。这些神经递质在突触前膜去极化后释放到突触间隙，随后激活突触后膜上的受体并触发影响神经元兴奋性、突触可塑性和各种生理过程的细胞内信号级联。正常生理情况下，从突触前神经元释放的神经递...

25 Jul

清华大学陈浩东课题组与合作者揭示光抑制植物胚轴负向重力性的新机制

光与重力是核心的物理环境因子，在植物的生长发育过程中发挥着重要的调控作用。植物的地上部分和地下部分都能对重力作出响应。根通常表现出正向重力性，即沿着重力方向向下生长，这有助于植物的固着以及营养与水分的吸收；而茎则通常表现出负向重力性，即背离重力方向向上生长，以便获取光能并进行空气交换。光对植物地上部分和地下部分的向重力性存在相反的调控作用，它抑制植物胚轴或茎的负向重力性，却促进根的正向重力性。...

19 Jul

生命学院孙前文团队揭示了植物异染色质染色中心形成的分子及进化机制

组成型异染色质由高度凝聚的染色质组成，通常包括着丝粒和着丝粒周围区域。它在染色质组织、转座子沉默和基因组稳定性中起着至关重要的作用。在很多物种中，DNA重复序列和转座子(TE)在组成型异染色质区域高度富集，并被DNA甲基化和抑制性组蛋白修饰所沉默。ADCP1是植物基因组中异染色质组蛋白修饰H3K9me2的阅读器，在调控异染色质形成、H3K9me2和CHG/CHH甲基化维持，以及转座子沉默中发挥关键作用。在间期细胞核中，组成型异染...

15 Jul

清华大学陈春来与刘俊杰课题组合作揭示CasX靶标搜索和切割过程的动态调控机制

CRISPR-Cas系统是细菌和古生菌中对抗外源核酸入侵的获得性免疫系统。基于CRISPR-Cas系统在RNA引导下靶向DNA的功能，已经开发了多种被广泛使用的基因编辑和调控工具。CasX（又称Cas12e）属于第2类CRISPR-Cas系统，因其体积较小，相较于广泛使用的Cas9和Cas12a蛋白更便于递送到细胞内，展现出巨大的应用潜力。但除了共有的RuvC核酸酶结构域外，CasX与Cas12a和Cas9在蛋白序列上相似性甚微。此外，CasX独有的NTSB结构域，对于其切...

13 Jun

生命学院张强锋课题组开发SPACE用于空间转录组数据分析

在多细胞生物体中，尽管所有细胞共享相同的基因组，但由于内部基因调控网络的差异以及与周围微环境中相邻细胞的外部信号交流，它们在形态、基因表达和功能上展现出显著的多样性。相邻的不同种类细胞之间再通过复杂的相互作用，形成一定功能的组织模块。近年来，随着空间转录组技术的不断发展，研究者能够在单细胞分辨率下获得细胞的基因表达谱，同时保留细胞在组织内的空间位置信息。因此，如何有效地利用这些空间位置信息来揭...

09 Jun

清华大学生命学院刘念团队发现LINE-1转录选择性激活远程基因表达

二十世纪五十年代，Barbara McClintocks首次在玉米中发现一类能在基因组中移动、改变自身位置的DNA序列——转座子，并在1983年获得诺贝尔生理学或医学奖。人类基因组中有接近一半的序列由转座子构成，其中，LINE-1 (Long interspersed nuclear element-1, L1) 占据了人类~17%的基因组序列，是目前人体内唯一活跃且具有自主逆转录转座能力的转座子。尽管L1在体细胞中的表达通常受到抑制，但L1在人和小鼠早期胚胎发育的合子基因组...

07 Jun

清华大学颉伟组和南京医科大学李晶组合作揭示增强子在卵子发生及早期胚胎发育中的转…

2024年6月5日，清华大学生命学院颉伟研究组与南京医科大学李晶研究组通过紧密合作，在《自然-细胞生物学》（Nature Cell Biology）期刊上报道了题为“小鼠卵母细胞和早期胚胎增强子鉴定揭示TCF3/12为卵泡发生的关键调控因子”（Mapping putative enhancers in mouse oocytes and early embryos reveals TCF3/12 as key folliculogenesis regulators）的研究论文。

05 Jun

生命学院李雪明课题组和电子系沈渊课题组合作开发冷冻电子断层成像倾转系列的离焦量…

冷冻电子断层成像（cryo-electron tomography, cryoET）技术可以观察细胞中生物大分子的原位结构，近年来受到了广泛关注。生物样品在冷冻电镜成像的过程中受到衬度传递函数（contrast transfer function, CTF）的影响，无法直接反映原始的结构信息。在实现高分辨率的蛋白质结构解析和电镜图像质量评估的过程中，依托CTF准确估计离焦量参数，对后续消除CTF的影响十分重要。目前常用的离焦量估计方法通常依托图像功率谱中的CTF衍...

03 Jun

生命学院魏迪明团队开发DNA折纸单链骨架从头合成方案

在过去几十年中，DNA 纳米技术已成为一个强大的平台，可以用于制造多样的纳米结构，从而在生命科学和材料科学领域开辟了众多的研究机会。其中 DNA 折纸方法已成为 DNA 纳米技术的主要突破之一。DNA 折纸结构的复杂性和可控性不断提高，展示了强大的自组装能力，可用于自下而上的纳米构建。尽管如此，快速生产高度定制的单链 DNA骨架链仍然是一个挑战。目前文献中提到的大多数 DNA 折纸结构都是使用具有固定长度和序列的 M13 噬...

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