刘俊杰 博士
副教授
2007-2011 四川大学，生命科学学院，学士
2011-2016 清华大学，生命科学学院，博士
2016-2018 劳伦斯-伯克利国家实验室--生物物理和生物成像中心，博士后
2018-2020 加州大学伯克利分校--细胞分子生物学系，博士后
2018-2020 美国生命科学研究基金（LSRF）研究员
2020至今 清华大学生命科学学院，助理教授、副教授
2020至今 清华-北大生命科学联合中心、北京生物结构前沿研究中心，研究员
● 研究兴趣、领域：
我们的团队致力于开发新型分子工具与生物计算方法，驱动生命科学领域的前沿研究：
（1）探索细菌免疫复合物（如CRISPR-Cas）、RNA核酶、转座子等生物大分子机器的多样性，开发新型生物大分子工具，设计并优化用于核酸操控与检测的先进分子工具。
（2）探索AI与具身智能在生命科学领域的应用，利用人工智能和具身智能技术，深入研究生物进化、基因组多样性等生物学问题。
● 代表性论文：
1. Jin S#, Zhu Z#, Li Y#, Zhang S#, Liu Y, Li D, Li Y, Luo Y, Cheng Z, Zhao KT, Gao Q, Yang G, Li H, Liang R, Zhang R, Qiu JL, Zhang YE*, Liu JJ*, Gao C*.Functional RNA splitting drove the evolutionary emergence of type V CRISPR-Cas systems from transposons. Cell. 2025 Oct 30; 188(22): 6283-6300.
2. Li D#, Zhang S#, Lin Shuo#, Xing WJ#, Yang Y, Zhu F, Su D*, Chen CL*, Liu JJ*. Cas12e orthologs evolve variable structural elements to facilitate dsDNA cleavage. Nat Commun. 2024 Dec 30;15(1):10727.
3. Xing WJ#, Li DY#, Wang WJ, Liu JJ*, Chen CL*. Conformational dynamics of CasX (Cas12e) in mediating DNA cleavage revealed by single-molecule FRET. Nucleic Acids Res. 2024 Aug 27;52(15):9014-9027.
4. Zhang SY#, Sun A#, Qian JM#, Lin S#, Xing W, Yang Y, Zhu HZ, Zhou XY, Guo YS, Liu Y, Meng Y, Jin SL, Song W, Li CP, Li Z, Jin S, Wang JH, Dong MQ, Gao C, Chen C*, Bai Y*, Liu JJ*. Pro-CRISPR PcrIIC1 associated Cas9 system for enhanced bacterial immunity. Nature. 2024 Jun;630(8016):484-492.
5. Liu ZX#, Zhang S#, Zhu HZ#, Chen ZH#, Yang Y#, Li LQ#, Lei Y, Liu Y, Li DY, Sun A, Li CP, Tan SQ, Wang GL, Shen JY, Jin S, Gao C, Liu JJ*. Hydrolytic endonucleolytic ribozyme (HYER) is programmable for sequence-specific DNA cleavage. Science, 2024 Feb 2; 383(6682): eadh4859.
6. Deng P#, Tan SQ#, Yang QY, Fu L, Wu Y, Zhu HZ, Sun L, Bao Z, Lin Y, Zhang QC, Wang H, Wang J*, Liu JJ*. Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon. Cell, 2023 Jun 22;186(13):2865-2879.
7. Li DY#, Li LQ#, Liu JJ*. Nucleases in gene-editing technologies: past and prologue. National Science Open, 2023 Jul 18;2(5): 20220067.
8. Hu Z#, Sun A#, Yang J, Naz G, Sun G, Li Z, Liu JJ*, Zhang S*, Zhang X*. Regulation of the CRISPR-Cas12a system by methylation and demethylation of guide RNA. Chemical Science, 2023,14(22):5945-5955.
9. Sun A#, Li CP#, Chen Z#, Zhang S#, Li DY, Yang Y, Li LQ, Zhao Y, Wang K, Li Z, Liu J, Liu S, Wang J*, Liu JJ*. The compact Casπ (Cas12l) ‘bracelet’ provides a unique structural platform for DNA manipulation. Cell Research, 2023 Mar;33(3), 229–244.
10. Tsuchida CA#, Zhang S#, Doost MS#, Zhao Y#, Wang J, O'Brien E, Fang H, Li CP, Li D, Hai ZY, Chuck J, Brötzmann J, Vartoumian A, Burstein D, Chen XW, Nogales E, Doudna JA*, Liu JJ*. Chimeric CRISPR-CasX enzymes and guide RNAs for improved genome editing activity. Mol. Cell, 2022 Mar 17;82(6):1199-1209.
11. Yang M, Sun R, Deng P, Yang Y, Wang W, Liu JJ*, Chen C*. Nonspecific interactions between SpCas9 and dsDNA sites located downstream of the PAM mediate facilitated diffusion to accelerate target search. Chem. Sci., 2021 Aug 20;12(38):12776-12784.
12. Liu TY#, Liu JJ#, Aditham AJ, Nogales E, Doudna JA*. Target preference of Type III-A CRISPR-Cas complexes at the transcription bubble. Nat. Commun., 2019 Jul 5;10(1):3001.
13. Liu JJ#, Orlova N#, Oakes BL#, Ma E, Spinner HB, Baney KLM, Chuck J, Tan D, Knott GJ, Harrington LB, Al-Shayeb B, Wagner A, Brötzmann J, Staahl BT, Taylor KL, Desmarais J, Nogales E*, Doudna JA*. Author Correction: CasX enzymes comprise a distinct family of RNA-guided genome editors. Nature, 2019 Apr;568(7752):E8-E10.
14. Jiang F#, Liu JJ#, Osuna BA#, Xu M, Berry JD, Rauch BJ, Nogales E, Bondy-Denomy J*, Doudna JA*. Temperature-Responsive Competitive Inhibition of CRISPR-Cas9. Mol. Cell, 2019 Feb 7;73(3):601-610.
15. Wright AV#, Liu JJ#, Knott GJ, Doxzen KW, Nogales E, Doudna JA*. Structures of the CRISPR genome integration complex. Science, 2017 Sep 15;357(6356):1113-1118.
#: Co-first author; *: Corresponding author
● 荣誉、奖励及参加学术团体的情况：
2024年 科学探索奖
2024年 谈家桢生命科学创新奖
2024年 CSBMB-Promega青年生物化学家
2023年 北京市优秀青年人才
2023年 贝时璋青年生物物理学家奖
2020年 加州大学伯克利分校突出博士后奖
2018年 美国生命科学研究基金奖（fellowship）
● 联系方式：
电子邮件：junjiegogoliu(at)tsinghua.edu.cn (联系时请把（at）改成@)
实验室网站：http://gogolab.life.tsinghua.edu.cn
电话：+86-010-62770270 (lab) +86-010-62770276 (office)
实验室通讯地址：北京市海淀区清华大学生物医学馆A401
