刘俊杰 博士

副教授


2007-2011,四川大学,生命科学学院,学士

2011-2016,清华大学,生命科学学院,博士

2016-2018,劳伦斯-伯克利国家实验室--生物物理和生物成像中心,博士后

2018-2020,加州大学伯克利分校--细胞分子生物学系,博士后

2018-2020,美国生命科学研究基金(LSRF)研究员

2020年10月起,清华大学生命科学学院、生命科学联合中心、生物结构前沿中心,助理教授、副教授

 

●  研究兴趣、领域:


本实验室主要利用生物信息学,生物化学,生物物理学以及细胞生物学手段从事以下研究

(1) 新型基因编辑工具的设计和开发

(2) 与RNA相关联的核酸酶机器的工作机理研究


●  代表性论文:


1. Deng P#, Tan SQ#, Yang QY, Fu L, Wu Y, Zhu HZ, Sun L, Bao Z, Lin Y, Zhang QC, Wang H, Wang J*, Liu JJ*. Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon. Cell. 2023 Jun 22;186(13):2865-2879.

2. Sun A#, Li CP#, Chen Z#, Zhang S#, Li DY, Yang Y, Li LQ, Zhao Y, Wang K, Li Z, Liu J, Liu S, Wang J*, Liu JJ*. The compact Casπ (Cas12l) 'bracelet' provides a unique structural platform for DNA manipulation. Cell Res. 2023 Mar;33(3):229-244.

3. Hu Z#, Sun A#, Yang J, Naz G, Sun G, Li Z, Liu JJ*, Zhang S*, Zhang X*. Regulation of the CRISPR-Cas12a system by methylation and demethylation of guide RNA. Chem Sci. 2023 May 9;14(22):5945-5955.

4. Li DY#, Li LQ#, Liu JJ*. Nucleases in gene-editing technologies: past and prologue. National Science Open. 2023

5. Tsuchida CA#, Zhang S#, Doost MS#, Zhao Y#, Wang J, O'Brien E, Fang H, Li CP, Li D, Hai ZY, Chuck J, Brötzmann J, Vartoumian A, Burstein D, Chen XW, Nogales E, Doudna JA*, Liu JJ*. Chimeric CRISPR-CasX enzymes and guide RNAs for improved genome editing activity. Mol Cell. 2022 Mar 17;82(6):1199-1209.

6. Yang M, Sun R, Deng P, Yang Y, Wang W, Liu JJ*, Chen C*. Nonspecific interactions between SpCas9 and dsDNA sites located downstream of the PAM mediate facilitated diffusion to accelerate target search. Chem Sci. 2021 Aug 20;12(38):12776-12784.

7. Liu TY#, Liu JJ#, Aditham AJ, Nogales E, Doudna JA*. Target preference of Type III-A CRISPR-Cas complexes at the transcription bubble. Nat Commun. 2019 Jul 5;10(1):3001.

8. Liu JJ#, Orlova N#, Oakes BL#, Ma E, Spinner HB, Baney KLM, Chuck J, Tan D, Knott GJ, Harrington LB, Al-Shayeb B, Wagner A, Brötzmann J, Staahl BT, Taylor KL, Desmarais J, Nogales E*, Doudna JA*. Author Correction: CasX enzymes comprise a distinct family of RNA-guided genome editors. Nature. 2019 Apr;568(7752):E8-E10.

9. Jiang F#, Liu JJ#, Osuna BA#, Xu M, Berry JD, Rauch BJ, Nogales E, Bondy-Denomy J*, Doudna JA*. Temperature-Responsive Competitive Inhibition of CRISPR-Cas9. Mol Cell. 2019 Feb 7;73(3):601-610.

10. Wright AV#, Liu JJ#, Knott GJ, Doxzen KW, Nogales E, Doudna JA*. Structures of the CRISPR genome integration complex. Science. 2017 Sep 15;357(6356):1113-1118.


#: Co-first author;    *: Corresponding author

 

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