郗乔然 博士

博士生导师,副教授


1989-1993年,南京大学生物化学系     学士

1998-2004年,美国纽约大学医学院     微生物学博士

2004-2005年,美国纽约大学医学院     博士后

2006-2013年,美国斯隆凯特琳癌症研究中心 博士后

2013年至今,  清华大学生命科学学院    研究员

 

●  研究兴趣、领域:

本课题组的学术研究主要是运用细胞生物学,生物化学,分子生物学,基因组学等方法研究TGF-beta信号传导在胚胎干细胞的自我更新和胚胎发育及癌症发生过程中的作用机制;针对性研究TGF-beta及相关信号传导通路如何通过与表观遗传图谱相互作用,在时间和空间上紧密调控基因表达从而调控胚胎发育及癌症发生。本课题组的研究对象是小鼠胚胎干细胞和弥漫内生型脑干胶质瘤(DIPG)。我们充分发挥自身TGF-beta生物学的研究优势,结合胚胎干细胞生物学,癌症生物学及交叉学科如信息科学、结构生物学开展了一系列的研究,进而揭示了许多TGF-beta信号通路的新的调控元件及机制。为深入了解早期胚胎发育及癌症发生提供了新的视角和理论基础。同时,我们也运用自身优势积极展开合作,和其他实验室一起回答了更广泛的生物学问题。

●  代表性论文:

1. Luo M, Bai J#, Liu B#, Yan P#, Zuo F, Sun H, Sun Y, Xu X, Song Z, Yang Y, Massagué J, Lan X, Lu Z, Chen YG, Deng H, Xie W, and Xi Q*. (2019) H3K18ac primes mesendodermal differentiation upon nodal signaling. Stem Cell Reports. 13(4): 642-656.
2. Sun Y#, Sun Y#, Yan K, Li Z, Xu C, Geng Y, Pan C, Chen X, Zhang l*, Xi Q*. (2019) Potent anti-tumor efficacy of palbociclib in H3.3K27M-mutant diffuse intrinsic pontine glioma. EBioMedicine. 43:171-179.
3. Tian W#, Yan P#, Xu N, Chakravorty A, Liefke R*, Xi Q* and Wang Z*. (2019) The HRP3 PWWP domain recognizes the minor groove of double-stranded DNA and recruits HRP3 to chromatin. Nucleic Acids Research. 47(10): 5436-5448.
4. Bai J, Xi Q*. (2018) Crosstalk between TGF-β signaling and epigenome. Acta Biochimica Biophys Sin. 50(1): 60-67. (Review)
5. Xia X, Zuo F, Luo M, Sun Y, Bai J, Xi Q*. (2017) Role of TRIM33 in Wnt signaling during mesendoderm differentiation. Sci China Life Sci. 60(10): 1142-1149.
6. Massagué J, and Xi Q. (2012) TGF-β control of stem cell differentiation genes. FEBS Letters 586: 1953-8. (Review)
7. Xi Q, Wang Z, Zaromytidou AI, Zhang XH, Chow-Tsang L, Liu JX, Kim H, Manova-Todorova K, Kaartinen V, Studer L, Mark W, Patel DJ, and Massagué J*. (2011) A poised chromatin platform for TGFβ access to master regulators. Cell 147: 1511-24.
8. Alarcón C, Zaromytidou AI#, Xi Q#, Gao S#, Yu J, Fujisawa S, Barlas A, Miller A, Manova-Todorova K, Sapkota G, Pan D, and Massagué J*. (2009) CDK8/9 kinases drive Smad transcriptional action and turnover in BMP and TGFβ pathways. Cell 139: 757-69.
9. Xi Q, He W, Zhang XH, Le HV, Massagué J*. (2008) Genome-wide impact of the BRG1 SWI/SNF chromatin remodeler on the transforming growth factor β transcriptional program. J Biol Chem. 283: 1146-55.
10. Xi Q, Cuesta R, and Schneider RJ*. (2005) Regulation of ribosome shunting translation by phosphotyrosine-dependent coupling of adenovirus 100k protein to viral mRNAs. J. Virol. 79: 5676-5683.
11. Xi Q, Cuesta R, and Schneider RJ*. (2004) Tethering of eIF4G to Adenoviral 100k protein drives ribosome shunting. Genes Dev. 18: 1997- 2009.

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